草创期

1836年，天主教蒙特利尔教区成立，为蒙特利尔大学的建立埋下了伏笔。

1843年，蒙特利尔医学与外科学学校（école de médecine et de chirurgie de Montréal）成立。

1851年，法律学校（école de droit）成立。

1873年，魁北克教育家宇荷杰勒—额鉴讷·阿荷尚堡（Urgel-Eugène Archambault）创办艺术与工业应用科学学校（école des sciences appliquée aux arts et à l'industrie），即蒙特利尔工学院的前身。

学校诞生期

1878年，拉瓦尔大学（Université Laval）以蒙特利尔医学与外科学学校、法律学校及神学院为基础，在蒙特利尔市区建立了拉瓦尔大学蒙特利尔校区（Université Laval à Montréal），这是蒙特利尔大学的前身。

1887年，预科学院（collège）成立，是魁北克省最早的普通与职业学院（collège d’enseignement général et professionnel，简称：Cégep）。同年，蒙特利尔工学院并入拉瓦尔大学蒙特利尔校区新成立的文学部。

1889年，罗马教廷赋予拉瓦尔大学独立的行政权。

1895年10月8日，该校在位于拉丁区的尚·德尼（Saint-Denis）路与尚特·卡特欣讷（Sainte-Catherine）路东南方向建了一座教学楼，而后来该教学楼成为魁北克大学蒙特利尔校区（Université du Québec à Montréal）建立的基础之一，即现在的雨别·阿康（Hubert-Aquin）楼。

1905年，蒙特利尔工学院位于尚·德尼路228号的建筑建成，即如今的魁北克大学蒙特利尔校区的阿塔纳斯·大卫（Athanase-David）楼。

1907年5月14日，以法国的大学校为蓝本的蒙特利尔高等商学院成立。

1911年，学校授予玛希·椎航—拉爪（Marie Gérin-Lajoie）学位，她因此成为加拿大第一位被授予文学士的法裔女性。

1915年，蒙特利尔高等商学院并入拉瓦尔大学蒙特利尔校区。

1917年，蒙特利尔高等商学院建立加拿大第一座工业博物馆，并设立第一个成人继续教育项目。

蒙昧期

1919年5月8日，路易—昼谢夫—拿破雷翁—箁勒·布税希（Louis-Joseph-Napoléon-Paul Bruchési）获得了圣座本笃十五世对于拉瓦尔大学蒙特利尔校区赋予的完全自治权，学校自此更名为“蒙特利尔大学”。[8] 

1920年2月14日，魁北克省承认了蒙特利尔大学的独立法人地位。同年，蒙特利尔工学院开始从属于蒙特利尔大学。

1920年至1925年间，该校发生了三次火灾并烧毁了部分建筑，因此在此期间该校曾重建了部分建筑。同时，哲学部、文学部、科学部、兽医学部、外科学部、牙外科学部、药剂学部、社会科学部相继成立，自此，蒙特利尔大学成为了一所非宗教的、世俗化的大学。

1922年，蒙特利尔大学学生总会（Association générale des étudiants de l’Université de Montréal）成立，这是该校第一个学生自治组织。

1927年，预科学院成为文学部（faculté des Arts）。

1930年，该校开始依据建筑师爱荷涅斯特·括荷米耶（Ernest Cormier）的设计图纸动工修建位于皇家山（Mont Royal）上新校址的建筑群。

理性期

1943年，大学整体搬迁至皇家山。 

1943年至1945年，为了执行曼哈顿计划，在大学主楼的西侧秘密设立了用于研究核反应堆的实验室，物理学家皮耶荷·德篾荷斯（Pierre Demers）曾在此工作。

1956年，蒙特利尔高等商学院搬迁至蒙特利尔大学的校园内。同年，学校成立加拿大第一个人口学系。

1962年，国立蒙特利尔大学职工工会（Syndicat national des employés de l’Université de Montréal）成立。

发展与现代化时期

1965年，整个魁北克省正沉浸在寂静革命的影响之下，化学家霍椎·苟德希（Roger Gaudry）应运出任校长，成为创校以来第一位非神职人员的校长。

1966年，学校委托有“魁北克城市规划之父”（père de l'urbanisme au Québec）之称的庄—克娄德·拉·阿耶（Jean-Claude La Haye）设计了新的学校标志。

1972年，文理学部与高等研究学部成立。

智慧期

1987年，文学与人文艺术图书馆从里翁涅勒·古（Lionel-Groulx）楼地下层整体变迁至萨缪岳勒·崩夫曼（Samuel-Bronfman）大楼。

1989年12月6日，发生“蒙特利尔工程学院大屠杀”（Tuerie de l'école polytechnique de Montréal）。

1996年，蒙特利尔高等商学院搬迁至蒙特利尔大学校园内。同年，蒙特利尔大学医疗中心（Centre hospitalier de l'Université de Montréal）成立。

1999年，该校成为罗兰奖学者基金会（Loran Scholars Foundation）的成员。

2001年，跨大学间生活阶段的产品、程序与服务研究中心（Centre interuniversitaire de recherche sur le cycle de vie des produits, procédés et services，简称：CIRAIG）成立。

2002年，蒙特利尔高等商学院的法语名称更改为“HEC Montréal”，直译为“蒙特利尔HEC”。

2005年，药剂学部、免疫学与癌症学研究所分别搬迁至庄·库都（Jean-Coutu）楼与玛荷歇勒·库都（Marcelle-Coutu）楼。

2006年，确定十月为“校友月”（Le mois des diplômés）。

蒙特利尔大学荣列2020泰晤士高等教育世界大学排名第85位，2019软科世界大学学术排名第151-200位；2020QS世界大学排名第137位，2020U.S. News世界大学排名第139位以及2020麦克林杂志加拿大医博类大学排名第10位。